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如何在终端ubuntu中下载fasta文件

阅读 16K 0. 版权声明：本文为博主原创文章，转载请注明博客地址： https://blog.csdn.net/zy010101/article/details/90613343. 在线安装. 在线安装程序的时候，需要你知道应用程序的名字，才能安装它。. 例如：sudo apt-get install tree，统一格式如下。. sudo apt -get install 名称. 来安装一个有趣的命令：sl。. 它能在你的终端里跑过一辆火车。. sudo apt -get install sl.

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再次用.sh文件的名字替换这里的“install.sh Step 1, 找到压缩文件夹。 请打开文件夹所在的目录路径。例如，要是它位于文档目录下，请打开“文档”文件夹。Step 2, 记下压缩文件夹的名称。 一会你需要输入压缩文件夹的确切名称，就是这里出现在目录文件夹中的具体名称。 包括账户名称中的空格，并区分大小写。Step 3, 点击菜单按钮。 它位于屏幕的左下角。 本教程教你如何在基于 Ubuntu 的 Linux 发行版上安装 MySQL。对于首次使用的用户，你将会学习到如何验证你的安装和第一次怎样去连接 MySQL。 MySQL 是一个典型的数据库管理系统。它被用于许多技术栈中，包括流行的… 这个指南将会跟你解释在 Ubuntu 20.04 上的 Anaconda Python 发行版安装过程。 一、 安装 Anaconda. 在写这篇文章的时候，Anaconda 最新绑定版本是 2020.02。在下载安装脚本之前，浏览下载页面，并且检查是否有更新的Anaconda 可用。 在 Ubuntu 20.04 上完成下面的步骤，安装 在Ubuntu 16.10和17.04中，你可以在Universe repository中找到Python 3.6包，并可以通过apt轻松地安装它，如下所示。 $ sudo apt update $ sudo apt install python3.6 要查看系统上安装的所有Python二进制文件的列表，请运行以下ls命令。 关闭终端后仍然需要运行服务器则. screen java -Xms512M -Xmx1024M -jar f orge-1.12.2-14.23.4.2705-universal.jar-nogui. 直接关闭或者Ctrl A+D退出screen即可. 如何添加mod？ 将下载好的Forge mod放在目录下，mods文件夹中，重新启动服务器即可。 关于server.properties配置文件 Deb是所有基于Debian的发行版使用的安装软件包格式。 Ubuntu信息库包含数千个deb软件包，可以从Ubuntu软件中心或使用apt和apt-get实用工具从命令行安装。在本教程中，我们将说明如何在Ubuntu 18.04上安装deb文件。相同的说明适用于Ubuntu 16.04和任何基于Debian的发行版，包括Debian，Linux Mint和Elementary OS。 解压缩HBase安装文件.

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sudo apt -get install sl. 在 Linux 中是没有 download 命令的，但是有几个 Linux 命令可用于下载文件。 在这篇终端技巧中，你将学习两种在 Linux 中使用命令行下载文件的方法。 我在这里使用的是 Ubuntu，但除了安装，其余的命令同样适用于所有其他 Linux 发行版。 2018-08-28 ubuntu怎么用终端下载网络上的软件; 2007-01-10 在 LINUX 命令行下 怎样下载一个网络上的文件？ 124; 2017-04-06 如何在ubuntu终端安装软件 1; 2012-10-13 ubuntu 用终端下载安装软件后的安装包在哪里？ 6; 2009-01-21 Ubuntu怎样用命令下载和安装软件？ 27 本文中，介绍在 Linux shell 中如何使用 ftp 命令。 包括如何连接 FTP 服务器，上传或下载文件以及创建文件夹。 尽管现在有许多不错的 FTP 桌面应用，但是在服务器、SSH、远程会话中命令行 ftp 命令还是有很多应用的。 Ubuntu下可以使用网易云音乐。首先，去网易云音乐官网下载deb安装包。然后在终端下进入下载好的安装包所在的位置。如果文件名过长，请先复制deb安装包的名称。下面我们安装网易云音乐。 ubuntu怎样打开终端（方法5种） 2018.05.19; ubuntu怎么切换到root用户,切换到root账号方法 2018.05.15; Ubuntu如何安装gcc编译器 2019.05.27; 怎么在Ubuntu中新建一个文件夹或者文件？ 2020.01.16; Ubuntu中安装vmware tools工具 2018.07.12 ubuntu在终端编辑完配置文件怎么退出,在这个系统上经常会在终端编辑一些文件的，那么编辑文件之后，如何退出编辑状态的了？很多人不是很清楚，下面就此说明一下。 在文件夹中打开的话，切换路径又没有linux终端快，于是，需要在命令行窗口中打开文件夹。如何做呢？ 来到终端命令行中，cd切换你的路径，使用命令 nautilus . 即可打开当前文件夹了，你想打开其他文件夹的话，自己换一下路径就行了。 也可以使用 xdg-open . 如何下载github文件,Githu作为一款开源的软件代码托管平台，当前很受欢迎，在项目开发过程中，我们经常会使用githu进行项目代码的上传和下载，那么当我们从githu上下载资源时，怎么进行文件的下载呢，本编经验可以帮助到你。 在GUI的桌面环境中，创建文件是很简单的，例如Windows平台中，大多数情况下只需要点击右键，就可以新建文本文档等各类文件。 在终端中创建文件，大体有这么三种方式，1、使用touch命令进行创建，2、使用文本编辑器进行创建，3、使用重定向符号进行创建： 把中文文件夹改成相应的英文文件夹，比如，效果如下 . 方法二： 打开终端，在终端中输入命令: export LANG=en_US . xdg-user-dirs-gtk-update .

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然后使用这个命令下载文件. 例如：. axel http://soft.vpser.net/lnmp/lnmp0.8-full.tar.gz. 就会自动下载文件了.

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Linux下BLAST+的本地化（BLAST 2.2.29+）

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里维斯社. 发布时间: 20-05-18 15:28 科技达人. 尽管Canonical在18.04中放弃了Ubuntu Unity桌面，但仍可以在新版本Ubuntu 20.04中使用它，并且该公司仍将其提供给所有喜欢使用它的人。 使用此窗口查找您先前下载的Ubuntu Unity Remix 从GitHub网站上下载electronic-wechat文件进行安装是第二种方案。在下载前，你需要选择适合自己的版本。笔者使用的是64位乌班图系统，下载了linux-x64.tar.gz.。 Linux实验室 在Ubuntu上装微信客户端 打开终端并输入以下命令解压文件： tar xvf linux-x64.tar.gz 了解如何使用基于 Windows 的计算机下载 Dell 计算机的操作系统恢复映像。Dell OS recovery tool 提供了一个轻松的界面，可快速下载并创建可引导 USB 驱动器，以重新安装操作系统。了解有关如何下载恢复映像、创建恢复 USB 驱动器以将操作系统安装到 Dell 计算机中的信息。 Jenkins是基于Java的，可以从Ubuntu软件包安装，也可以通过下载和运行其Web应用程序存档（WAR）文件来安装 - 该文件是构成在服务器上运行的完整Web应用程序的文件集合。 在终端窗口中 如何在Ubuntu 18.04上安装Redis. 本文介绍了如何在 Linux 系统上安装 Thunderbird。其他操作系统，参见在Windows中安装Thunderbird和在 Mac 中安装 Thunderbird。. 许多 Linux 的版本都默认包含 Thunderbird，并且大都含有软件包管理系统，能让您轻松安装 Thunderbird。 Ubuntu自带了一个GUI（Graphical User Interface，图形化用户界面）软件包管理器，它可以让你在一个可视化窗口中卸载程序。如果你不习惯使用命令行，这一工具将非常有用。 点击系统，然后选择管理。在管理菜单中，选择Synaptic软件包管理器。 rtty - 在任何地方通过Web访问您的设备的终端 它由客户端和服务端组成。客户端采用纯C实现。服务端采用GO语言实现，前端界面采用vue实现。 您可以在任何地方通过Web访问您的设备的终端。通过设备ID来区分您的不同的设备。 在工作中，很多人都会使用到虚拟机，在虚拟机安装系统，但是装完系统之后，有很多不便，通过VMware Tools才能解决这些问题，下面小编给大家介绍一下如何在Ubuntu中安装VMware Tools！ ubuntu 16.04系统是一个自由、开源的操作系统，它基于Debian，但有自己的发行版(每六个月发行一版)，以用户为核心，简单易用(“能用”就行)，承诺对 在设置中将 Cascadia Code PL 设置为 fontFace Set Cascadia Code PL as fontFace in settings.

用.sh文件的名字替换这里的 install.sh ，按下 回车键 。. 最后，运行.sh文件。. 输入以下命令： sudo ./install.sh 。.

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要退出保存的，则输入【：wq】，强制保存退出，则输入【：wq！. 】。. 1、首先进入到ubuntu中，打开终端，如图所示。 2、然后输入解压软件安装命令【sudo apt install unzip】，如图所示。 3、输入密码进行安装，等待安装完成，如图所示。 4、安装完成后，找到需解压的文件右击鼠标，在出现的菜单中选择“解压命令”点击。 在通常情况下，Linux 系统默认自带了 Python 开发环境。下面以 Ubuntu（Linux 发行版之一）为例来介绍在 Linux 系统上安装 Python 的步骤。 打‘&’的目的是让文件在后台运行，命令行终端还能用。. 如果忘了打&可以 Ctrl+z，然后打bg回车. 文件名中含空格要打成'\ '. 2、对 文本文档 的增删改查；.

FASTA格式- 维基百科，自由的百科全书

访问网址http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/. 2. 下载faSomeRecords脚本. 6.4 计算GTF文件中基因所拥有的平均转录本数目 · 6.5 生成一个多行Fasta测试序列供后续运算( Linux下文件有一个特殊的属性即可执行属性，用来指示这个文件是一个可执行的脚本或 首先下载Anaconda的安装包https://www.continuum.io/downloads。 交互式运行容器 docker run -it ubuntu , 这时可以发现终端的用户名变了. 从网上下载的DNA序列在做生物信息或者机器学习之前，需要对序列进行质控 大部分序列最好将fasta文件序列文件变成一行，而上面显示是多行fasta 所以序列末尾和linux终端命令连在一起，因此在序列最后末尾加上换行符： Linux 下用的最多的下载工具莫过于wget 和curl，这两个工具虽然堪称经典。但其单线程的 也就是可以从多个地址或者从一个地址的多个连接来下载同一个文件，类似迅雷，总之就是下载速度比wget 快，而且快很多。 axel -n 50 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/swissprot.gz MobaXterm 是一个全功能的终端软件。 绝对路径指的是目录或文件的绝对位置，是从根目录开始的完整路径，如“/home/bio/” 终端（terminal）是运行Linux命令的工具，类似于Windows的命令行工具 使用wget工具下载基因组拼接软件“AbySS”到tools目录下。 示例：通过apt-get在Ubuntu中安装AbySS软件，输入命令和密码后， fasta文件内容  我在Ubuntu 14.04.x机器上有一个应用程序。此应用程序对PDF文件进行文本挖掘。我怀疑它正在使用Apache Tika等 问题在于，在阅读过程中，我收到以下警告：. 2015-09-10 在Python中解析FASTA文件时遇到问题. 来自分类 尝试下载pdf文件时线程被中止问题 Gnuplot PDF终端在Mac上显示字体问题.

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在下载一个文件之前，我们首先需要使用lcd命令设定本地接受目录位置。 lcd / home / user / yourdirectoryname; 如果你不指定下载目录，文件将会下载到你登录 FTP 时候的工作目录。 现在，我们可以使用命令 get 来下载文件，比如： get file; 文件会保存在使用lcd命令设置的目录位置。 Ubuntu中anaconda的安装及使用. （1） 在anaconda官方网站中下载相应的包。. 网址>> https://www.anaconda.com/download/#linux. （2） 在Ubuntu的终端窗口中找到下载的anaconda的目录，执行命令。. 命令>>bash Anaconda3-5.2.0-Linux-x86_64.sh. image.png.

wget其他命令（-h查看）可以参考. https://www.cnblogs.com/peida/archive/2013/03/18/2965369.html. https://www.gnu.org/software/wget/manual/wget.html#Simple-Usage. 使用命令行下载文件.